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猛犸象為何滅絕基因組提供新線索

文章作者:www.rkizep.icu發布時間:2020-02-02瀏覽次數:1288

也許你還記得電影中的兩個可愛的猛犸象《冰河世紀》,但事實上它們在公元前2000年已經滅絕了。科學家正在尋找猛犸象從剩余骨骼中消失的線索。最近,一個國際研究小組在《Current Biology》雜志上發表了他們的研究成果。

研究小組由瑞典自然歷史博物館的研究人員領導。他們測試了兩只猛犸象的標本,其中一只來自西伯利亞,約年前,另一只來自弗蘭格爾島,大約4300年前,不久之后猛犸象滅絕了。

利用這兩個新測序的猛犸象基因組,研究人員發現了遺傳多樣性的下降和與弗蘭格爾島近親繁殖有關的序列的增加,但為什么猛犸象在幾百年后死亡。一個謎。該文章的第一作者Eleftheria Palkopoulou說:“我們仍然無法確定滅絕的原因。”

考古研究表明,在更新世或晚更新世期間,猛犸象的數量是穩定的。然而,在年前的更新世末期和全新世的開始,幾乎所有的這種動物都消失了,只剩下幾個島嶼。弗蘭格爾島上的猛犸象代表了最后一批,持續了4000多年。

Palkopoulou及其同事對弗蘭格爾島上的一個猛犸齲樣本進行了全基因組測序,這個樣本大約有4300年的歷史。他們處理樣品以去除在古老的DNA降解期間通過胞嘧啶脫氨作用形成的尿嘧啶,使用Illumina的HiSeq 2500測序,并與非洲大草原的大象參考基因組進行比較。

加拿大合作者使用類似的方法對大約44,800年前來自西伯利亞Oimakang的猛犸象的軟組織樣本中的DNA進行測序。在晚更新世期間,一大群猛犸象居住在該地區。

對于弗蘭克爾島上的個體,超過四分之三的猛犸象讀取大象基因組,平均覆蓋深度為11.2倍。對于Oemiacan猛犸象序列,比較比率略低(約64%),平均覆蓋深度為17倍。

線粒體基因組序列表明,猛犸象屬于以前認為在100萬年前有分枝的母系。然而,基于X染色體和常染色體染色體的序列,作者希望這個分支在大約5萬年前更加接近。

研究人員尚未確定導致猛犸象人口顯著減少的具體事件。 “我們不確定它是否與天氣有關,”Palkopoulou說。沒有人類狩獵。這是絕對的。所以有點令人費解的是他們突然遇到了瓶頸。

最后,基因組分析表明,弗蘭格爾島標本的遺傳變異減少,其雜合序列比其他標本少約五分之一。這些和其他數據與弗蘭克爾島的種群數量減少一致,表明更頻繁的近親繁殖加速了滅絕。即便如此,Palkopoulou認為需要更多的研究來追蹤下降軌跡。 “猛犸象在島上生活了6000年,但在4000年前突然消失了,”她指出。

瑞典研究人員正在篩查其他弗蘭格爾島標本,希望找到最適合測序的基因組,以解決猛犸象滅絕的神秘面紗。

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